Caracterización molecular de accesiones de ñame (Dioscorea alata L.) de la región caribe colombiana

Molecular characterization of yam (Dioscorea alata L.) accessions from the colombian caribbean region

Contenido principal del artículo

Hernando Rivera Jiménez
Andrés Álvarez
Juan Palacio Mejía
Alba Ochoa

Resumen

El ñame (Dioscorea spp.) hace parte esencial de la dieta de la Costa Norte colombiana, donde es cultivado, llegando, incluso, a ser parte de su identidad cultural. Como estrategia para la conservación, el conocimiento y el uso de esta agrobiodiversidad, la Universidad de Córdoba ha logrado consolidar una colección de germoplasma de ñame, dentro de la que se destacan 14 accesiones de la especie Disocorea alata L., la especie más representativa de la colección. El conocimiento de esta colección comenzó con una caracterización morfológica, que es ahora complementada con la presente caracterización molecular. El objetivo de esta investigación fue evaluar la variabilidad genética de D. alata y cómo se relaciona con la caracterización morfológica, previamente realizada, utilizando para ello los marcadores moleculares AFLP. Los datos fueron analizados mediante los métodos de agrupación de análisis correspondencia múltiple y análisis de similaridad de Dice, estableciendo los niveles de confiabilidad de los grupos genéticos formados mediante remuestreos. La variabilidad genética de las 14 accesiones de ñame fue alta, permitiendo diferenciar cuatro grupos y dos sub-grupos, mediante un patrón de organización estructural bien definido, con una asociación de caracteres moleculares, botánicos y morfológicos, al interior de cada grupo.

Palabras clave:

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Detalles del artículo

Referencias (VER)

ÁLVAREZ, A. 2000. Prácticas agronómicas para el cultivo del ñame. En: Ñame, producción de semilla por biotecnología. Editorial Unibiblos Bogotá, Colombia. Universidad Nacional de Colombia. p.33-39.

BONIN, A.; EHRICH, D.; MANEL, S. 2007. Statistical analysis of amplified fragment length polymorphism data: a toolbox for molecular ecologists and evolutionists. Molecular Ecology. 16:3737-3758.

CAMPO, R.; LUNA, J.M.; JIMÉNEZ, Y. 2009. Selección de genotipos de ñame Dioscorea spp., resistentes a la antracnosis (Colletotrichum gloeosporiodes Penz). Fitopat. Col. 33(1):7-10.

DANSI, A.; MIGNOUNA, H.D.; ZOUNDJIHEKPON, J.; SANGARE, A.; ASIEDU, R.; AHOUSSOU, N. 2000. Using isozyme polymorphism to assess genetic variation within cultivated yams (Dioscorea cayenensis/Dioscorea rotundata complex) of the Republic of Benin. Genet. Resour. Crop Evol. 47:371- 383.

HAMON, P.; TOURÉ, B. 1990a. Characterization of traditional yam varieties belonging to the Dioscorea cayenensis-rotundata complex by their isozymic patterns. Euphytica. 46:101-107.

HAMON, P.; TOURÉ, B. 1990b. The classification of cultivated yams (Dioscorea cayenensis-rotundata complex) of West Africa. Euphytica 47:179-187.

LEBOT, V.; TRILLES, B.; NOYER, J.L.; MODESTO, J. 1998. Genetic relationships between Dioscorea alata L. cultivars. Genet. Resour. Crop Evolut. 45:499-508.

MALAPA, R.; ARNAU, G.; NOYER, J.L.; LEBOT, V. 2005. Genetic diversity of the greater yam (Dioscorea alata L.) and relatedness to D. nummularia Lam. and D. transversa Br. as revealed with AFLP markers. Genet. Res. Crop Evol. 52:919-929.

MIGNOUNA, H.D.; ELLIS, N.T.H.; KNOX, M.R.; ASIEDU, R.; NG, Q.N. 1998. Analysis of genetic diversity in Guinea yams (Dioscorea spp.) using AFLP fi nger printing. Trop. Agric. (Trinidad). 75:224-229.

NEI, M.; LI, W.H. 1979. Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endo Nucleases. Proc. Nal Acad. Sci. of the United States of America. 76(10):5269-5273.

OBIDIEGWU, J.E.; ASIEDU, R.; ENE-OBONG, E.E.; MUONEKE, C.O.; KOLESNIKOVA-ALLEN, M. 2009. Genetic characterization of some water yam (Dioscorea alata L.) accessions in West Africa with simple sequence repeats. J. Food, Agr. & Environm. 7(3&4):634-638.

PETRO, D.; ONYEKA, T.J.; ETIENNE, S.; RUBENS, S. 2011. An intraspecific genetic map of water yam (Dioscorea alata L.) based on AFLP markers and QTL analysis for anthracnose resistance. Euphytica. 179:405-416.

RAMSER, J.; WEISING, K.; LÓPEZ-PERALTA, C.; TERHALLE, W.; TERAUCHI, R.; KAHL, G. 1997. Molecular marker based taxonomy and phylogeny of Guinea yam (Dioscorea rotundata-D. cayenensis). Genome. 40:903-915.

RIVERA-JIMÉNEZ, H.; ÁLVARES, A.; PALACIO, J.; BARRIOS, D.; LOPEZ, D. 2011. Diversidad genética intra e inter-especifica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe colombiana mediante marcadores AFLP. Acta Agr. 60(4):328-338.

ROHLF, F. 1998. NTSYSpc. Numerical taxonomic and multivariated analysis system, vol 2.0, Exeter Software, Setauket, New York, USA.

SCARCELLI, N.; TOSTAIN, S.; MARIAC, C.; AGBANGLA, C.; Da, O.; BERTHAUD, J.; PHAM, J. 2006. Genetic nature of yams (Dioscorea sp.) domesticated by farmers in Benin (West Africa). Gen. Res. Crop Evol. 53:121-130.

SONIBARE, M.A.; ASIEDU. R.; ALBACH, D.C. 2010. Genetic diversity of Dioscorea dumetorum (Kunth) Pax using Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLP) and cpDNA. Biochem. Syst. Ecol. 38:320- 334.

TAMIRU, M.; BECKER, H.; MAASS, B. 2007. Genetic diversity in yam germplasm from Ethiopia and their relatedness to the main cultivated Dioscorea species assessed by AFLP markers. Crop Sci. 47:1744-1753.

VOS, P.; HOGERS, R.; BLEEKER, M.; REIJANS, M.; VAN DE LEE, T.; HORNES, M.; FRIJTERS, A.; POT, J.; PELEMAN, J.; KUIPER, M.; ZABEAU. M. 1995. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Res. 23:4407-4414.

YAP, I.V.; NELSON, R.J. 1996. WINBOOT: A program for performing bootstrap analysis of binary data to determine the confidence limit of UPGMA based dendrograms. IRRI Discussion Paper Ser. 14. IRRI, Los Baños, Philippines.

Citado por

Artículos similares

<< < 30 31 32 33 34 35 36 > >> 

También puede {advancedSearchLink} para este artículo.

Datos de la Publicación

Métrica
Éste artículo
Otros artículos
Pares Evaluadores 
0
2.4

Perfiles de revisores  N/D

Declaraciones del autor

Declaraciones del autor
Éste artículo
Otros artículos
Datos de Investigación 
No
16%
Financiación externa 
No
32%
Conflicto de Intereses 
N/D
11%
Métrica
Para esta revista
Otras Revistas
Tasa de aceptación 
16%
33%
Tiempo publicación (días) 
2076
145
Editor y consejo editorial:
Perfiles
Institución responsable 
Universidad de Ciencias Aplicadas UDCA
Editora: 
Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A